Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC10A2Q12908 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms