Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP53BP1Q12888 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms