Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBRQ0VD83 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms