Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NIPAL4Q0D2K0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms