Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PUDPQ08623 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms