Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TFF3Q07654 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms