Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABPAQ06546 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABPAQ06546 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms