Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms