Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7AQ04656 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP7AQ04656 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms