Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PLOD1Q02809 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms