Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFRSF17Q02223 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms