Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIBQ01892 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms