Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F1Q01094 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms