Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms