Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF9Q00978 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms