Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MYBPC1Q00872 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYBPC1Q00872 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms