Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK3Q00526 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms