Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ELF3P78545 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ELF3P78545 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ELF3P78545 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELF3P78545 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELF3P78545 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELF3P78545 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELF3P78545 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELF3P78545 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ELF3P78545 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ELF3P78545 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ELF3P78545 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms