Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX3P78415 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX3P78415 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX3P78415 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRX3P78415 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRX3P78415 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms