Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP1P78357 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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