Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB1P62873 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB1P62873 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB1P62873 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms