Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVPABLB-1P60509 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms