Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BACE1P56817 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BACE1P56817 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BACE1P56817 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms