Protein–RNA interactions for Protein: P56134

ATP5J2, ATP synthase subunit f, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5J2P56134 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5J2P56134 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms