Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP9P55211 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms