Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR5P51681 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR5P51681 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR5P51681 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR5P51681 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR5P51681 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCR5P51681 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCR5P51681 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCR5P51681 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCR5P51681 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCR5P51681 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms