Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms