Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETV1P50549 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms