Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP153P49790 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP153P49790 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP153P49790 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP153P49790 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP153P49790 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP153P49790 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP153P49790 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP153P49790 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP153P49790 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP153P49790 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP153P49790 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP153P49790 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP153P49790 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP153P49790 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP153P49790 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP153P49790 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP153P49790 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP153P49790 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP153P49790 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP153P49790 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP153P49790 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP153P49790 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP153P49790 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP153P49790 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP153P49790 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP153P49790 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP153P49790 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP153P49790 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms