Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP2P42575 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP2P42575 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP2P42575 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP2P42575 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP2P42575 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP2P42575 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP2P42575 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP2P42575 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP2P42575 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP2P42575 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP2P42575 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP2P42575 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP2P42575 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP2P42575 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP2P42575 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP2P42575 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms