Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMPOP42166 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMPOP42166 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMPOP42166 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMPOP42166 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms