Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms