Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SPRR1AP35321 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms