Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD1P33897 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD1P33897 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms