Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms