Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms