Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP1P30622 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms