Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CMPK1P30085 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CMPK1P30085 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms