Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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PTPRMP28827 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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PTPRMP28827 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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PTPRMP28827 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
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PTPRMP28827 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
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PTPRMP28827 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRMP28827 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
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PTPRMP28827 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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PTPRMP28827 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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PTPRMP28827 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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PTPRMP28827 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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PTPRMP28827 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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PTPRMP28827 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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PTPRMP28827 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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PTPRMP28827 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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PTPRMP28827 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRMP28827 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
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