Protein–RNA interactions for Protein: P28799

GRN, Granulins, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRNP28799 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRNP28799 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRNP28799 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRNP28799 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRNP28799 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRNP28799 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRNP28799 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRNP28799 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRNP28799 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRNP28799 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GRNP28799 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRNP28799 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRNP28799 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms