Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCAP28676 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCAP28676 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCAP28676 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCAP28676 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms