Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX2P28328 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX2P28328 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX2P28328 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX2P28328 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX2P28328 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX2P28328 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEX2P28328 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEX2P28328 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEX2P28328 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms