Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRZ1P23471 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRZ1P23471 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
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