Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XPAP23025 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XPAP23025 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
XPAP23025 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XPAP23025 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XPAP23025 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XPAP23025 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XPAP23025 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XPAP23025 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XPAP23025 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XPAP23025 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XPAP23025 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XPAP23025 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XPAP23025 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XPAP23025 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XPAP23025 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XPAP23025 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XPAP23025 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XPAP23025 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XPAP23025 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XPAP23025 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XPAP23025 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms