Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL3P19876 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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