Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM21P19474 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM21P19474 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms