Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRAP18433 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRAP18433 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRAP18433 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRAP18433 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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