Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MUC1P15941 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MUC1P15941 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC1P15941 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC1P15941 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC1P15941 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC1P15941 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC1P15941 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC1P15941 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC1P15941 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC1P15941 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC1P15941 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MUC1P15941 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MUC1P15941 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUC1P15941 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms