Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT13P13646 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT13P13646 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT13P13646 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT13P13646 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT13P13646 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT13P13646 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT13P13646 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT13P13646 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT13P13646 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms