Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGAMP11215 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms